Государственная инспекция по маломерным судам была образована постановлением Совета Министров РСФСР 15 июня 1984 года. Тогда ее главной задачей являлось упорядочение пользования маломерными судами. В 2003 году инспекция была передана в ведение МЧС России.

Шире стал и круг решаемых задач.  ГИМС МЧС России стала не только осуществлять государственный надзор за маломерными судами и базами для их стоянок и их пользованием во внутренних водах и территориальных  морях Российской Федерации, но также обеспечивать в пределах своей компетенции безопасность людей на водных объектах, в том числе осуществляя надзор за пляжами, ледовыми переправами и наплавными мостами, проводя аттестацию на право управления маломерными судами.

С начала купального сезона в 2019 году ГИМС МЧС России выявлено 2466 необорудованных мест массового отдыха населения на водоемах, из них на 2037 — купание запрещено, на 902 необорудованных местах массового отдыха созданы мобильные подразделения — временные спасательные посты, 140 оборудованы как пляжи, освидетельствованы и разрешены к пользованию.

Основными итогами работы МЧС России по обеспечению безопасности людей является снижение количества происшествий на водных объектах Российской Федерации на 10% по сравнению с 2018 годом, а также снижение гибели людей на 11,7%.